北交所和新三板的区别：
1、交易场所不同：北交所在北京证券交易所交易；新三板是全国中小企业股份转让系统，属于场外市场。
2、交易门槛不同：北交所交易需要两年及以上的股票交易经验和50万元及以上日均资产；新三板创新层需要两年及以上的股票交易经验和100万元及以上日均资产，新三板基础层需要两年及以上的股票交易经验和200万元及以上日均资产。
3、交易规则不同：新股上市首日不设涨跌幅限制，首日后涨跌幅限制为30%，每一交易单位为100股，以1股进行递增；新三板创新层涨跌幅限制为50%，新三板基础层涨跌幅限制为100%，每一交易单位为100股，以1股进行递增。
北交所是隶属于新三板的公司，并且北交所已经上市了而新三板没有上市。
北交所全名是北京证券交易所有限责任公司，是全国中小企业股份转让系统有限责任公司（简称“股转公司”，即新三板）的全资子公司。业内已经习惯将新三板的主管机构股转公司等同于新三板，因此，广义的新三板（大新三板）包括基础层、创新层、精选层。
在交易系统方面，北京证券交易所将延续以连续竞价为核心的选择层交易系统。交易申报的最低数量为100股，每次申报可增加1股。新股上市首日起涨跌不限，次日起涨跌幅度为30%。
对于在北京证券交易所开市前已开放选择层交易权限的投资者，其交易权限将自动转移到北京证券交易所。同时，北京证券交易所将坚持与新第三板的创新层和基础层的集成发展和系统联动。新第三板的创新层和基础层的交易机构投资者的交易权限将包括北京证券交易所的股票。
“新三板”是经国务院批准设立的全国性证券交易所，全国中小企业股份转让系统有限公司为其经营管理机构。